Liebe Artefakt geplagte Fotografen.
Es ist doch sooooooooooooooooo einfach diese mistigen Störungen zu beseitigen. ;D
Dazu wird nur ein weiteres Leerbild, also ohne das gewünschte Objekt gemacht und durch ein kleines freeware-Programm gedreht.
das aufgenommene Rohbild mit allen Störungen
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29867_24428686.jpg)
das Leerbild ohne Objekt, aber mit allen Bildartefakten !
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29867_25549067.jpg)
Das Programm GIOTTO kann mit wenigen Mausklicks ein bereinigtes Bild liefern.
Im www unter GIOTTO suchen und Programm laden.
1. Rohbild laden.
2. unter BEARBEITEN das Flatfield laden
3. Flatfield aktivieren und ausführen
4. fertiges Bild speichern
hier den Befehl Flatfield aktivieren
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29867_8857363.jpg)
...und das Resultat, ohne sonstige Nachbearbeitung
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29867_63037041.jpg)
So kann auch eine A620 in Telestellung des Zooms und schönen Ringen und Staub auf Okular und anderen Linsenflächen ein ordentliches Mikrobild liefern.
Viel Spass bei der Reinigung ;D
Peter Höbel
Zum Vergleich:
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29869_18094558.jpg)
(hatte natürlich nicht das Original mit 7 Megapixeln, sondern nur das Forum-Bild zur Verfügung)
Besten Mikrogruß
Heribert Cypionka
Hallo Herr Cypionka,
bin ich nun sehr kräftig in ein Fettnäpfchen getreten ???
Es ist die Gewohnheit mit alten/uralten Programmen sehr vertraut zu sein. Aber ich werde auch ihre Version mal testen.
Grüße in den Norden
Peter Höbel
@ Herr Cypionka,
leider gelingt es mir nicht mit der Funktion ein "gereinigtes Bild" zu erzeugen. Mehr konnte ich auch mit einigen Versuchen nicht erreichen. Sicher stehe ich mal wieder auf der Leitung. :D
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/29879_8948761.jpg)
Viele Grüße
Peter Höbel
Hallo Peter,
hast Du einmal die Reihenfolge von Leer- und Rohbild in der Picolay-Maske getauscht?
Liebe Grüße
Frank
Habe es gerade einmal ausprobiert.
Die Reihenfolge ist nicht der Grund für das dunkle Resultat sondern für "Target color" muss erneut grau gewählt werden.
Lieber Peter, lieber Heribert Cypionka,
raffiniert! Das muß ich mir unbedingt merken und hoffe, daß ich es auch nachvollziehen kann. Bei mir bilden sich nämlich Schmutzpartikel, die in der Leuchtfeldblende sitzen bei den kleinen Objektiven (6,3x, 10x) direkt in der Mitte des Bildes ab. Die verschwinden nur wenn ich den Kondensor herunterdrehe - und damit die vorgeschriebene Beleuchtungseinstellung verstelle.
Vielen Dank und liebe Grüße
Regi
Hallo,
das Prinzip Flatfield etc. ist mir schon klar. Nur was mir nicht klar ist: Woher bekomme ich ein Leerbild? Wenn es sich um kameraproduzierte Artefakte handelt, ist es kein Problem. Was macht man, wenn man Aufnahmen im Grenzbereich Makro/Mikro macht. Bisher habe ich, wenn möglich, mit opaken Hintergrund gearbeitet. Das ist aber nicht immer möglich. Ausweg war die Lassofunktion, die aber nur recht grenzwertig funktioniert.
Viele Grüße
Günther Langer
Hallo
Ich kann nur nochmals auf meinen Beitrag (#6) in folgendem Thread verweisen.
Das ist eine einfache und problemlose Methode. Es wird nur jedes mal ein Bild ohne Objekt benötigt.
All die Fehler der Kameraoptik, Kondensorverschmutzungen können leicht beseitigt werden.
http://www.mikroskopie-forum.de/index.php?topic=3059.0
Gruss Horst
Hallo,
wenn ich Picolay in der Version von 2008 verwende, funktioniert die Subtraktion der Hintergrundstörungen wie beschrieben. Hier kann durch Rechtsclick in den Untergrund des originalbildes die Untergrundfarbe bzw. der Hintergrund-Grauton für das korrigierte Bild vorgegeben werden, so dass die Diatomee auf hellgrauem Untergrund abgebildet wird. In der neuesten Version von Picolay (Jan. 2010), scheint diese Option zu fehlen. Hier finde ich nur noch die Möglichkeit, die betreffenden Bilder automatisiert voneinander abzuziehen. Logischerweise ist nun im bereinigten Bild der Hintergrund nahezu schwarz, wie im Beitrag von peter-h gezeigt, und von der Diatomee sieht man fast nichts mehr.
Da ich annehme, dass die neueste Version von Picolay nicht Optionen der Vorgängerversion abgespeckt hat, wäre ich für einen Hinweis dankbar, wie sich der Hintergrundton in der aktuellen Picolay-Version vorwählen lässt.
Anmerkung: Bei Giotto bleibt der Hintergrund in Ton und Helligkeit automatisch original, allerdings erscheint mir das Picolay-Resultat im direkten vergleich insgesamt "sauberer", mit etws homogenerem Untergrund und etwas besserer Konturschärfe.
Viele Grüße
jörg Piper
Hallo,
leider habe ich auch kein Glück mit der Flatfield-Funktion in Picolay 2010-01-17. Ich kann zwar die Hintergrundfarbe wählen, das Resultat ist aber einfach nur ein Bild in eben der gewählten Farbe ohne weitere Zeichnung.
Gruß! -- felix
Hallo,
auch ich habe es mit Picolay probiert, Version 2009-09-01:
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30105_48953616.jpg)
Gestacktes Bild
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30105_55429074.jpg)
Anwendung der Flat-Field-Correction.
Der Hintergrund ist zwar etwas sauberer, aber das Bild wirkt total anders. :-
Gruß
Bernd
Hmm ....Picolay - Version 2010-01-13
das Ergebnis ist doch gut, oder?
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30123_25794785.jpg) (http://www.fotos-hochladen.net)
Die Grundfarben können auch noch verändert werden!
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30123_19914648.jpg) (http://www.fotos-hochladen.net)
Herzliche Grüße
Frank
Hallo Frank,
diesen Farbwert hatte ich auch eingestellt. Dann bekommt man dieses Grau als Hintergrund.
Aber wenn man das Bild bei Phasenkontrast aufgenommen hat, wird aus dem schönen Hellblau auch so ein grauer Hintergrund. So wollte ich das nicht, es sei denn, ich finde den richtigen Wert bei den drei Parametern für R, G und B.
Gruß
Bernd
Zitat von: Piper in Januar 23, 2010, 14:31:25 NACHMITTAGS
Hallo,
wenn ich Picolay in der Version von 2008 verwende, funktioniert die Subtraktion der Hintergrundstörungen wie beschrieben. Hier kann durch Rechtsclick in den Untergrund des originalbildes die Untergrundfarbe bzw. der Hintergrund-Grauton für das korrigierte Bild vorgegeben werden, so dass die Diatomee auf hellgrauem Untergrund abgebildet wird. In der neuesten Version von Picolay (Jan. 2010), scheint diese Option zu fehlen. Hier finde ich nur noch die Möglichkeit, die betreffenden Bilder automatisiert voneinander abzuziehen.
Aber in der aktuellen Version funktioniert es doch mit dem Rechtsclick auf dem Originalbild!
Freundliche Grüße
Frank
Liebe Leute, >:( >:( >:(
ich habe die Version 2010-01-17 und kann mich auf den Kopf stellen und mit den Füßen wackeln, aber Picolay will nicht, oder ich bin tatsächlich zu dumm !
Ich frage mich aber auch, warum es mit anderen Programmen so einfach geht ???
Sicher ist Picolay mächtig, oder übermächtig ?
Liegt es nun wirklich an meinem grenzenlosen Unverständnis für Spezialprogramme, oder ist in dieser Version doch etwas nicht so wie es soll ?
Ratlose Grüße von einem der zunächst bei GIOTTO bleibt - Mausklick und fertig - !
P. Höbel
Lieber Herr Höbel,
ich möchte Sie trösten, auch ich scheine weiterhin zu "dumm" zu sein, um mit Picolay 2010 den Untergrund adäquat im bereinigten Bild aufzuhellen. Soweit ich bei den meinerseits heruntergeladenen Versionen feststellen kann, habe ich nur in der Vorgängerversion (von 2008) die Möglichkeit, bei der Bildsubtraktion den Hintergrund durch Mausklick im Originalbild vorzugeben. Die Option "Set background" fehlt einfach im Bearbeitungsfenster bei der neuesten Version, wenn die Bildsubtraktion gewählt wird. Zwar kann ein separates Bearbeitungsmakro aufgerufen werden, um einen Bildhintergrund zu kreieren (auch über Mausclick ins Originalbild), allerdings bekomme ich dann nur einen homogen grauen Hintergrund ohne jegliche Objektstrukturen. Ob oder wie man beide Bearbeitungsalgorithmen mireinander kombinieren kann, ist mir unklar.
Fazit: Mir bleibt nur Picolay Version 2008 und/oder Giotto in der aktuellen Version.
Kleiner Nachtrag / Korrektur zu meiner Wortmeldung, speziell für Herrn Höbel und Felix, die ebenso wie ich nicht zum Ziel kamen:
Picolay 2010 funktioniert tatsächlich doch in der gewünschten Weise, wenn man die beiden Bilder (Objekktbild und objektfreies Bild mit Hintergrundartefakten) lädt und anschließend als ersten und einzigen Bearbeitungsschritt das Makro "Set Background / Flatfield" anwählt (und nicht das separate Makro "Add or Substract 1st Image"). In diesem Fall ist das Bearbeitungsergebnis identisch mit demjenigen der Vorgängerversion. Wenn man allerdings die beiden Ausgangsbilder lädt, zuerst eine Bildsubtraktion versucht (über das Makro "Add or Substract 1st Image") und anschließend die Hintergrundanpassung vornehmen will, wird das zuvor erstellte, weitgehend schwarze Subtraktionsbild in einer zweiten Bearbeitungsstufe in ein nahezu homogenes Graubild ohne erkennbare Objektdetails umgewandelt. Diesem Bedienungsfehler war ich offenbar aufgesessen.
Korrigiertes Fazit: Auch die aktuelle Picolay-Version ist gleichermaßen geeignet, wenn man sie richtig bedient.
Schönen Restabend
Jörg Piper
Hallo Herr Piper,
danke für Ihre Nachricht und die Hilfestellung, nur leider geht es bei mir auch mit dieser Information nicht ???
Vermutlich gibt es noch eine versteckte Einstellung oder in einer INI-Datei ist der Wurm drin.
Ich hoffe und warte nun bis zur Tagung in Emden, wo ich den Durchbruch von Picolay ganz sicher erleben werde. Wie ich "reinigen" kann hatte ich gezeigt und die Restfehler werden weiter händisch korrigiert.
Für die Canon 450D und die ImagingSource DBK41 benötige ich sowieso kein Flatfield. Einzig bei sehr heiklen Aufnahmen an der Auflösungsgrenze mit UV-Licht bei 365nm und der monochromen Kamera von Lumenera ist es zwingend nötig ein Flatfield zu erzeugen und zu nutzen. (Amphipleura pellucida mit Grenzauflösung unter 180nm).
Die Canon A620 war nur als Beispiel für die schönen Ringartefakte adaptiert ;)
Ein schönes Wochenede und Grüße
Peter Höbel
Hallo,
nach einigen Experimentieren mit dem Picolay-Programm bin ich zu der Erkenntnis gekommen, daß sich diese Bildartefakte wenn man als erstes Bild eine Aufnahme hat, das außer den Artefakten keinen Inhalt hat. Das bekommt man z.B. durch Defokussierung, wobei zwar kein Objekt aufgenommen wird, aber die Staubpartikel auf dem Chip trotzdem fotografiert werden, weil sie eben immer da sind, egal wie man fokussiert.
Wenn man diesen unerwünschten Bildinhalt per Algorithmus vom erwünschten Bildinhalt abziehen kann, bleibt theoretisch zumindest, das "schöne" Bild.
Wenn man aber ein Bild mit allen Inhalten vom selbigen subtrahiert, bleibt logischerweise die graue, schwarze oder sonstige Fläche, die man durch die drei Parameter einstellen kann ohne weiteren Bildinhalt.
Liebe frustierte Picolay-Nutzer,
die Diskussion hat mich veranlasst, Programmier-Fehler zu suchen - und ich bin fündig geworden - :) oder :-[
Jedenfalls habe ich Buße getan und folgende Verbesserungen eingebracht:
- Wie hier angemerkt (DANKE!), gab es unkorrekte Ergebnisse, wenn man vor dem Flatfield-Verfahren andere Routinen (z.B. Bilder abziehen oder addieren) hat laufen lassen. Das habe ich hoffentlich durch Weglassen von 5 Programmzeilen behoben.
- Als Verbesserung bieten nun sowohl das Flatfield-Verfahren als auch das Weißabgleich-Verfahren automatisch eine Zielfarbe an, die aus dem aktuell im Bildfenster befindlichen Bild gewonnen wird (Median aus 100 zufällig ausgewählten Pixeln). Man braucht also einen Klick weniger (und wird kaum mehr wie Herr Höbel aus Versehen das Schwarze treffen). Das muss aber nicht immer die beste Lösung sein. Man kann nach wie vor durch einen Klick mit der RECHTEN Maustaste ins Bild eine Farbe auswählen oder das zusätzliche Farbwahl-Fenster öffnen.
- Die Anleitung (Deutsch und Englisch) wurde aktualisiert.
- Das deutsche Tutorial hat zwei zusätzliche Kapitelchen zum Flatfield-Verfahren und Weißabgfleich bekommen.
Alles zu finden unter http://www.picolay.de
Danke für alle Hinweise auf Programmfehler. Wer sich nicht sicher ist, ob's einer ist, kann ja per mail Anfragen - ich gebe mir nach wie vor gern Mühe, es fast allen recht zu machen.
Heribert Cypionka
Hallo nochmal,
so frustrierend ist das gar nicht. Und dennoch habe ich es mit der aktuellen Version mal an einem Beispiel getestet:
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30216_39762658.jpg)
Hier ein Bild von einer Kieselalge, es dürfte sich um eine Form der Navicula handeln.
Aufgenommen ohne irgendwelche Bearbeitung.
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30216_44489159.jpg)
Ein "Leerbild", aufgenommen in einer anderen Fokusebene. Der Vergleich zeigt, daß diese Verunreinigungen in jedem Bild mit aufgenommen werden. :o
(https://www.mikroskopie-forum.de/pictures001/30216_55855115.jpg)
Die FFC-Funktion bei Picolay putzt die Optik ohne Pinsel. :D
Nochmals besten Dank für die Anregung und für das Update!
Nomarski
Erst einmal möchte ich mich bei Herrn Cypionka recht herzlich für PICOLAY bedanken.
Für mich, der sich erst seit kurzem mit den Stapelaufnahmen intensiver beschäftigt, ist dieses Programm ein enormer Zugewinn;
das Bildergebnis bekommt, ähnlich dem Blick durch ein Stereomikroskop, nun einen räumlichen Charakter.
Ein Vorschlag für die Flatfieldaufnahme und der damit verbundenen Artefakte wie Reflexion, Staub/Schmutz, Vignettierung oder Pixelfehler
ist die Anfertigung eines Leerpräparates.
Dazu habe ich einen sehr sauberen Objektträger mit Kanadabalsam und einem, ebenfalls gut gereinigten, Deckglas bedeckt.
Dieses Leerpräparat wird nun an Stelle des bereits fokussierten und richtig beleuchteten Präparates auf den Mikroskoptisch gelegt und so das "Weißbild" aufgenommen.
Natürlich kann der Objektträger mit dem abzulichtenden Präparat auch so weit verschoben werden, bis ein "leerer" Bereich sichtbar wird.
Häufig zeigen sich aber hier Verschmutzungen auf Präparatebene, die dann negativ in die Korrektur einfließen.
Herzliche Grüße
Frank