HISTOLOGIE: Zoombares Bild einer Rattenniere

Begonnen von microvisioneer, Juni 28, 2016, 19:13:27 NACHMITTAGS

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microvisioneer

Hallo zusammen,

ich wollte euch gerne einmal ein zoombares Bild einer Rattenniere zeigen. Weil es so groß ist hab ich es bei easyzoom hochgeladen. https://easyzoom.com/image/92834

Das Bild wurde mit einem Olympus BX-60 und einem Olympus UPLANSAPO20X/0.75 NA aufgenommen.
Kameraadapter 0.63x und eine PointGrey C-Mount Kamera mit 5MP (3,45 Mikrometer große Pixel).

Das Gesamtbild wurde mit einem Prototyp meiner Software für manuelles Whole Slide Imaging erstellt.
Der ganze Scan hat etwa 3 Minuten gedauert.
Ein Demo-Video von dem Scan gibt es auch. https://www.youtube.com/watch?v=aXYnAfZ4bD4

Ich bin auf euer Feedback zur Bildqualität gespannt.

Viele Grüße und viel Spaß beim zoomen.

Josef
ermöglicht Slide-Scanning mit manuellen Mikroskopen.

Klaus Herrmann

Hallo Josef,

also ich bin ja nun wirklich nicht der berufene Experte, aber ich finde das Ganze ist etwas flau. Natürlich muss man berücksichtigen, dass das eine ganze Niere ist und dann kann die Auflösung nicht so gut sein, als wenn man ein Detail mit einem 60er Öl-Objektiv anschaut. Aber das 20er Planapo ist ja auch schon ganz ordentlich. Was ist das denn für eine Färbung? Die ist auch nicht so kontrastreich, wie eine Azan.

Ich bin gespannt auf das Urteil der wirklichen Experten!
Mit herzlichen Mikrogrüßen

Klaus


ich ziehe das freundschaftliche "Du" vor! ∞ λ ¼


Vorstellung: hier klicken

Ralf Feller

Hallo Josef,
ich finde das sehr beeindruckend. Wenn man in so kurzer Zeit ein ganzes Präparat scannen kann ist das einfach toll. Über die Färbung kann man sich streiten, ich denke es ist eine vereinfachte Azan-Färbung. Der Detailreichtum beim einzoomen ist aber gut. Ich würde so etwas für die Histologie durchaus kaufen, vorausgesetzt es ist wirklich so einfach wie Du zeigst. Ich hätte gerne mehr Infos.

viele Grüße, Ralf

microvisioneer

Hallo Klaus,
Hallo Ralf,

die Färbung ist Azan n. Geidies. Das Präparat stammt von Morphisto aus Frankfurt.
Die Software ist noch nicht fertig, und daher werden die Bilder bisher ohne die typischen Verbesserungen aneinandergesetzt. Hier kann man in der Tat noch sattere Farben und bessere Kontraste erwarten.

Solange die Präparate so gleichmäßig dick sind wie diese Niere ist es einfach.
Anspruchsvoller ist es beispielsweise, einen Schnitt mit Knochen zu digitalisieren.
Da ändert sich die Schnittdicke öfters und zwingt einen während der Aufnahme eines Streifens zum nachfokussieren.

Viele Grüße

Josef
ermöglicht Slide-Scanning mit manuellen Mikroskopen.

Ronald Schulte

Josef,

Ich finde die Bildqualität nicht richtig toll aber wenn ich sehe wie superschnell das alles geht hat es sicher Potenz! Wenn ich so ein Präparat einscanne und fertig habe kostet es mir schon zwei mal ein ganzen Abend.
Verstehen tue ich das ganze aber noch nicht Gans weil ich z.B. jedes einzelne Bild an Scharfe Justieren muss und hier werden so in ein streifen so 30 Bilder aufgenommen.
Eine nähere Erklärung wie das Funktioniert wurde ich gerne mal lesen. Vielleicht in ein PN wenn Sie nicht alles Veröffentlichen möchten wäre auch prima.

Grusse Ronald
Mikroskope:
Leitz Orthoplan (DL, AL-Fluoreszenz und Diskussionseinrichtung).
Leica/Wild M715 Stereomikroskop.
Mikrotom:
LKB 2218 Historange Rotationsmikrotom.

microvisioneer

Hallo Ronald,

ganze Streifen aus vielen Bildern aufnehmen ohne zu fokussieren geht natürlich nur wenn das Präparat eine gleichmäßige Schnittdicke hat.
Dann reicht es, alle paar Streifen einmal nachzufokussieren. Ich kontrolliere immer während des Scans die Bildqualität und fokussiere am Mikroskop nach.
Die Software funktioniert so, dass überlappend ganz viele Bilder aufgenommen werden und live zu einem nahtlosen Gesamtbild zusammengesetzt werden.
Außerdem ersetzt die Software unscharfe Bildinformation durch schärfere. Du kannst also wenn du merkst, dass der letzte Streifen unscharf geworden ist nachfokussieren und einfach das Präparat "zurück" bewegen.
Dann wird das unscharfe Bild durch das schärfere Bild ersetzt.

Viele Grüße

Josef
ermöglicht Slide-Scanning mit manuellen Mikroskopen.