ZEISS Zen - Info View

[momotaro]

Dear All,
Lieber Peter,
Lieber Michael,

wer kann sich noch an all die Daten seiner Aufnahmen von 2022 erinnern.
Wer hat Zeit und Muße seine Dokumentation zu pflegen und auf dem neuesten Stand zu halten.
Ein Wermutstropfen, die Daten können nicht mit Copy/Paste in eine PDF oder Word Datei übertragen werden; und der Screenshot lässt sich nicht mit OCR maschinenlesbar machen.

LG Helmut

[beamish]

Hallo Helmut,
versuch mal den Screenshot mit Photoshop umzukehren, dann in Graustufen umwandeln und die Gradationskurve hochziehen, daß es SW nahekommt. Dann könnte es mit OCR klappen.

Grüße
Martin

[Noch so'n Michael]

Hallo Helmut,

eigentlich müssten alle Daten in der Zeiss-eigenen CZI-Datei vorliegen (falls du diese abgespeichert hast, was grundsätzlich eine gute Idee ist  ). Daraus ließen sich diese z.B. mittels Bio-Formats auslesen, siehe hier:
https://docs.openmicroscopy.org/bio-formats/5.7.0/metadata/ZeissCZIReader.html

Dies sollte auch einigermaßen bequem z.B. in FIJI / ImageJ oder mit einem kleinen selbstgeschriebenen Python-Programm funktionieren, behauptet zumindest Zeiss selbst:
https://www.zeiss.com/microscopy/de/produkte/software/zeiss-zen/czi-bilddateiformat.html

Falls du diesbezüglich auf Probleme stößt, könnte ich vermutlich weiterhelfen, auch wenn ich gerade keine fertige Lösung zur Hand habe.

Beste Grüße,
noch so'n Michael