Bearbeitung von CCD Bildern

treinisch · März 03, 2011, 22:29:24 NACHMITTAGS

Hallo Stefan,

ich nehme mein letztes Posting zurück und behaupte das Gegenteil!
Danke für Dein Beharrungsvermögen!

Viele liebe Grüße

Timm

treinisch · März 04, 2011, 00:11:37 VORMITTAG

Hallo Stefan,

ich habe mir ein kleines
Programm für den Mac geschrieben, um ein wenig mit
dieser Korrektur zu experimentieren.

Wenn Du magst, kannst du es ja auch mal ausprobieren, ist jedenfalls blitzschnell geladen,
weil nur 200kb groß. Einfach die Bilder in das jeweilige Feld ziehen und fertig ;-))

Viele liebe Grüße

Timm

Edit: Typos

Stefan_O · März 04, 2011, 07:34:27 VORMITTAG

Hi Timm,

das Programm sieht gut aus, ich habe es heruntergeladen und werde mal damit spielen. Ich muss aber leider noch eine Lektion in Geduld über mich ergehen lassen: das Gleichspannungsnetzteil für die Halogenlampe ist immer noch nicht eingetroffen. Ohne das keine Kamerabenutzung.

Kann man die Bittiefe der Bilder einstellen, oder wird die automatisch erkannt? Geht es auch mit Farbbildern? Ansonsten entspricht es so ziemlich meinem Wunschtraum. Wie und womit (Programmiersprachen/Software) hast Du es geschrieben?

Eigentlich sollte man es an die Macher von Macnification schicken. Deren nächste Version soll angeblich Bilder von CCD Kameras aufnehmen können, da sollte es die Korrekturen auch machen können. Dann wäre der Workflow komfortabel in einem Programm vereinigt.

Gruss,
Stefan

Nur was für Leute mit schönen Rechnern:
http://www.macnification.com/

treinisch · März 04, 2011, 09:10:27 VORMITTAG

Hallo Stefan,

Zitat von: Stefan_O in März 04, 2011, 07:34:27 VORMITTAG
Kann man die Bittiefe der Bilder einstellen, oder wird die automatisch erkannt? Geht es auch mit Farbbildern?

die Bittiefe wird zwar automatisch erkannt, aber sinnvolle Schlussfolgerungen werden nur für 8 Bit pro Kanal gezogen. Wäre
aber eine Sache von Sekunden das entsprechend anzupassen. Mein Testbild ist technisch gesehen ein Farbbild, also ja, Farbe geht natürlich.

Zitat von: Stefan_O in März 04, 2011, 07:34:27 VORMITTAG
Wie und womit (Programmiersprachen/Software) hast Du es geschrieben?

Es ist ja sicher Geschmackssache, aber so wie ich Macs liebe, liebe ich auch das Programmieren auf
Macs. Das kleine Tool ist ganz (Apple-)normal mit XCode in Objective C programmiert, keine
zusätzlichen Bibliotheken, deswegen ist es auch so klein und schnell :-). Eigentlich wäre es noch
viel kleiner, aber das Programmsymbol hat schon 220kB ;-)

Viele liebe Grüße

Timm

P.S. Macnification werde ich mir mal ansehen!

Stefan_O · März 04, 2011, 09:17:45 VORMITTAG

Hallo Timm,

ich möchte nicht unverschämt erscheinen, aber 12 bit Eingabe und Ausgabe wäre cool. Welches Bildformat braucht das Programm? Geht tiff?

Liebe Grüsse,
Stefan

treinisch · März 04, 2011, 09:29:16 VORMITTAG

Hallo Stefan,

ich fühle mich durch dein Interesse an meiner kleinen Fingerübung durchaus geehrt.

Dateiformat müsste eigentlich völlig egal sein, sogar RAW sollte gehen, auch wenn man
das wegen der fehlenden Einstellungsmöglichkeiten natürlich nicht will.

Schick mir doch einfach mal so ein 12-Bit tiff, dann probiere ich es direkt aus, sollte wie
gesagt nur ein paar Sekunden dauern das einzubauen. Email-Adresse sende ich dir per PM.

Gerade sehe ich, EMail geht auch über das Brieflogo links unter meinem Foto. Bin gespannt!

Viele liebe Grüße

Timm

Edit: EMail Hinweis

treinisch · März 04, 2011, 10:19:46 VORMITTAG

Hallo,

ein Hinweis für alle, die das Programm auch bespielen wollen:
Es läuft nur auf 10.6, dafür gibt es aber keinen besonderen Grund
ausser Faulheit (compiler default ;-) )
ich stelle später noch eine Version ein, die auch auf 10.5.x läuft.

Viele liebe Grüße

Timm

Chipart · März 04, 2011, 12:21:24 NACHMITTAGS

Zitat von: Stefan_O in März 03, 2011, 12:48:54 NACHMITTAGS
Dunkelstrom sehe ich ein, das Weissbild würde beim Mikroskop aber dazu dienen den Dreck auf der Optik wegzurechnen und eventuelle ungleichmässige Beleuchtung auszubügeln, salopp gesagt. Ich habe oben den Link zu einem Dokument gepostet, dass gut zeigt, was beim Spreizen eines Weissabgleichbildes zum Vorschein kommt. Ich fand das ganz eindrucksvoll. Die Aufgabe hat es auch in der Astronomie, wenn ich die Seiten zum Thema richtig interpretiere. Seltsam eigentlich, dass die Bildverarbeitung in der Astronomie weit fortgeschrittener ist, als in der Mikroskopie.

Stimmt schon - allerdings ist ein korrektes Weissbild in der Mikroskopie alles andere, als trivial zu erstellen: Man braucht ja ein homogen weisses Präparat, dass sehr genau die gleiche Schichtdicke haben muss, wie das später zu photographierende Präparat (damit man die Fokuseinstellung nicht verändern muss).

Daher finde ich es auch wenig seltsam, dass die Bildverarbeitung in der Astronomie deutlich weiter fortgeschritten ist: Während man dort wegen der typischerweise sehr dunkeln Objekte um jedes einzelne detektierte Lichtquant kämpfen muss, hat man bei Mikroskopen in der Regel genug Licht zur verfügung, so dass alles einfacher ist. Dies zusammen mit den Teils erheblich gößreren Schwierigkeiten führt dazu, dass es halt niemand macht...

Gruss,
Chip

Klaus Herrmann · März 04, 2011, 12:50:35 NACHMITTAGS

Hallo,

ZitatStimmt schon - allerdings ist ein korrektes Weissbild in der Mikroskopie alles andere, als trivial zu erstellen: Man braucht ja ein homogen weisses Präparat, dass sehr genau die gleiche Schichtdicke haben muss, wie das später zu photographierende Präparat (damit man die Fokuseinstellung nicht verändern muss).

Ich dachte immer in meiner Unschuld, dass es reicht, wenn man auf eine leere saubere Stelle des Präparats geht, dabei nichts verändert, und dann den Weißabgleich macht danach zurück aufs Präparat und die Aufnahme ist dann korrekt weiß abgeglichen?
Bei Auflicht verwende ich allerdings ein Weißnormal, das ist aufwändiger!

Stefan_O · März 04, 2011, 12:55:32 NACHMITTAGS

Eigentlich hat Klaus recht: Durchlicht: sauberes Teil vom Objektträger, Auflicht: Weiss- oder Reflektionsstandard. Ist nicht so kompliziert.....

Siehe Link zum Tutorial:

"Now open the light path, remove the specimen (the image is all background) and capture a shot. Save it as "Brightfield"; it will be used to compensate the background illumination. "

Gruss,
Stefan

treinisch · März 04, 2011, 14:07:20 NACHMITTAGS

Hallo,

Zitat von: treinisch in März 04, 2011, 00:11:37 VORMITTAG
ich habe mir ein kleines
Programm für den Mac geschrieben, um ein wenig mit
dieser Korrektur zu experimentieren.

unter der selben Adresse liegt nun eine Programmversion bereit, die zusätzlich 8 Bit mit Alpha-Kanal und
16 Bit (darunter fallen auch 12 Bit) ohne Alpha-Kanal unterstützt. Ferner wird MacOS 10.5 unterstützt und
auch Rechner mit PPC-Prozessor. Ausserdem ist ein kleiner Bug in der Speicherverwaltung behoben.

Viele liebe Grüße

Timm

Stefan_O · März 09, 2011, 20:07:58 NACHMITTAGS

Salü Zusammen,

auch hier noch ein Nachtrag. Da meine Beleuchtung inzwischen wieder funktionsfähig ist, konnte ich erste echte Tests mit McFlat machen. Selbst ein Quick-and-Dirty Weissbild auf einem Stück "weisser" Pappe gemacht bringt eine sichtbare Verbesserung. Die Bildhelligkeit ist nach der Korrektur gleichmässiger, das Bild wirkt klarer. Ich freue mich schon auf den Tag, an dem der bereits bestellte Weissstandard eintrifft.

Nochmals vielen Dank an Timm für das Programmieren und die Fehlerkorrekturen!

Gruss,
Stefan