3D Seitenansicht einer komplexen Diatomeen mit Helicon Focus u. PICOLAY

[rlu]

Hallo,

Es ist folgende Frage in einem Nachbarbeitrag aufgekommen, zur der ich eine Lösung gefunden habe.

ist es möglich den Stapel so zu drehen, dass man auf die Außenseite schaut?

3D-Ansicht, Helicon Focus, Methode B(Tiefenabbild)
Der Hintergrund wurde farblich angepasst.
Vorteil dieser Methode, es geht rasend schnell mit einem guten Ergebnis.
Man braucht, dazu keinen Kreuzblick zu können, den vermutlich nicht mehr als 10% der Menschen beherrschen.
Und selbst mit Kreuzblick ist dieses Merkmal nicht so gut zu sehen.


Was ist die wahre Form dieser Diatomeen?
Basierend auf dem Bild und dem Tiefenabbild ist das kein klassischer geometrischer Zylinder.
Denn in der Mitte gibt es eine Einschnürung.
Beispiel: Coscinodiscus
Zu sehen ist die Tiefenkarte mit der der Verrechnungsmethode B in Helicon Focus.


Seitenansicht. Ob das jetzt die ganze Wahrheit ist?
Interessant wäre es zu wissen, ob die wirklich so aussehen?

Tool mp4->gif:
https://ezgif.com/

Liebe Grüße
Rudolf

[rlu]

Hallo,

Hintergrund aus einer Auswahl an Einzelbildern geputzt; was Arbeit macht.


Liebe Grüße
Rudolf

[Heribert Cypionka]

Lieber Rudolf,

ich will dir noch mal den Gefallen tun, auf deinen Post zu antworten, kommentiere aber die Qualität der Ergebnisse nicht. Meine Bilder sind komplett unbearbeitet und mit den Parametern gewonnen, die in dieser Namensliste stehen:



bu=bottom-up, td=top-down, enh=horizontale Spiegelung, #1=Filterset, fil2=Filter, pa-5=Patches um 5 Pixel reduziert, pam100=Pixels above Minimum zu 100% berücksichtigt, _en=Kontrast und Schärfe automatisch erhöht

Normales Stacking (max. Schärfe):


Tiefenkarte dazu:


Oberfläche, Overlay Pixel mit Score>13:

Tiefenkarte dazu:


Blick von unten (Stapelreihenfolge gedreht, Overlay Pixel mit Score>13, Ergebnis horizontal gespiegelt):

Tiefenkarte dazu:


Für die Anaglyphenbrille: Topview


Bottom view:


Auf die Animation habe ich verzichtet.

Hier noch die Ansichten in 2D, farbreduziert: https://www.picolay.de/forum/max-top-bottom-view.jpg

Lieben Gruß,
Heribert

[rlu]

Hallo Heribert,

vielen Dank für die Hinweise. Hier ein kleiner Einschub zu Picolay:

Mit dem neuen Algorithmus ,,Pixel > min. score" kommt man zu einer Ansicht der Rückseite, wenn man die richtigen Einstellungen kennt(C).
Die Oberfläche von der Vorderseite kann sichtbar gemacht werden, auch wenn die Kontraste nicht sehr stark sind.( ,,Pixel > min. score")(B).




Codierung Anweisungsstring
z.B:
py stk #1 sub15 pa-5 fil2 pam100 en
py map #1 sub15 pa-5 fil2 pam100 en (Zugehörige Tiefenkarte)
#1=Filterset, fil2=Filter, pa-5=Patches um 5 Pixel reduziert, pam100=Pixels above Minimum zu 100%
berücksichtigt, _en=Kontrast und Schärfe automatisch erhöht(macht man danach), stk = Stackingbild, map = Tiefenkarte
Hi100, Lo100, die oberen, bzw. die unteren Bilder bevorzugt berücksichtigen

Zuordnung der Stacking Parameter zu den Stacking Einstellungen

Parameter    Einstellung
#1          "Filter set 1": vermutlich so was wie Radius und Kontrast, ab wann soll ein Pixel berücksichtigt werden
fil2        Fixed(1-10) 2, und ist Feintuning zu "Filter set"

Filter(ganz was anderes als "Filter set":
sub15        "Minimum score/noise suppressor 15" wie fein soll Tiefenkarte gelegt werden, bestimmt auch Stacking Bild
pa-5        "Narrow or widen patches(-/+10) -5" erweitert oder verkleinert den Bereich. Negative Werte verkleinern den Bereich
pam100      "Pixel größer min. score 100", wie stark werden schwache Pixel berücksichtigt
map              zeigt Tiefenkarte immer an.
Test 4 Filter    Settings(hier nicht hilfreich), da das "Filter set"=4 gewählt ist
Align            eher nicht verwenden, Freihand, Wind, Größenänderung etc.

Nicht Codierung:
wird nicht vom Programm erzeugt, kann aber händisch eingetragen werden. Sinnvolle Ergänzung zur Übersichtlichkeit.
picoly beginnt die Bezeichnung mit ,,py"
bu=bottom-up, td=top-down, enh=horizontale Spiegelung
diese kann händisch durch einen anderen Text ersetzt werden. Hier z.B. ,,Cocino_enhbu"
Cocino_enhbu(horzintale Spiegelung)(Bottum up), wurde händisch eingetragen
die Reihenfolge muss gedreht werden über: Menü/Image list/Reverse Order oder ,,Ctrl+O", Spiegelung erfolgt über linkes Fenster/Enhance/Flip/horziontal – ,,Apply to all marked images"

Coscino_td




Zur Orientierung was ist vorne und was ist hinten zu sehen.
Ansicht von Hinten:
Pfeile zeigen auf einen kleine Rhombus und markanten schwarzen Fleck
Oberfläche ist hinten geschlossen

Ansicht von Vorne:
Oberfläche hat im Zentrum einen Durchbruch

Beim Stacking werden die ersten Bilder mit der nächsen Distanz aufgenomen
Das letzte Bild ist am weitesten entfernt.
Dreht man die Reihenfolge um, dann ist logischerweise das letzte das hinterste und gleichzeitig die Ebene vom Objektträger. Hier Bild 083.jpg oder weil die Reihenfolge umgedreht wurde trägt es die Bezeichnung ,,enhclip83.jpg".







Folgende Dinge haben die Nachvollziehbarkeit  positiv verändert:
•    Testdaten zu der Diatomeen sind bereitgestellt, denn ohne Testdaten macht das alles keinen Sinn.
•    Die Codierung für die Berechnung ist jetzt bekannt und kann nachgestellt werden. Damit wird ein Standard erreicht, wie im Stacking Forum, wo die Aufnahmeparameter bekannt gegeben werden.
•    Die Testdateien sind so klein, dass die Berechnung schnell ausgeführt wird.

Liebe Grüße
Rudolf