Die ersten (etwas unbeholfenen) Stacking Versuche

[SamuelReicher]

Abend,

Ich dachte ich versuche das mal, verwendet wurde Picolay

Objektiv 20
Canon EOS700D

Zwischen 10 und 12 Bildern pro Stack

Alle Larven haben überlebt und wurden wieder in ihr Habitat "ausgewildert" es musste also kein Tier für die Aufnahmen sterben 

Tipps und was in den Einstellungen Vorteile bringt sind (höchst) willkommen. habe absolut keine Erfahrung damit 

[Heribert Cypionka]

Hallo Samuel,

mit 12 Bildern wird das bei einem so tiefen Objekt mit komplexen Strukturen sicher nicht gut. Versuch doch mal Videostacking wie hier beschrieben. Ich nehme 300 Schichten für ein Objekt mit 50 µm Tiefe. Auch mit dem 10er Objektiv und auch wenn deine Kamera nur 2 k-Videos kann, dürften bessere Ergebnisse erreichbar sein...

Versuch's mal - bei weiteren Fragen bin ich gern behilflich!
Heribert

[A. Büschlen]

Hallo Samuel,

ich bin kein Stacking Anwender.

Aber nimm doch zum üben ein Dauerpräparat. z.B. ein gefärbter Stängelquerschnitt.

Grüsse Arnold Büschlen

[rlu]

Hallo Samuel,

einfach machen.

Bei Picolay wäre noch interessant wie die Tiefenkarte aussieht. Dazu beim Stacken, wenn du den Dialog mit F2 öffnest, auch noch "Save depth map" anklicken. Dann sieht man so ein weiteres Bild, dass grün, blau, gelb, grau ist. Damit wird gesteuert welches Bild aus dem Stapel verwendet wird. Gelb ist vorne, grün mitte, blau hinten, grau auch hinten.
Die Bilder werden mit einem  kryptischen Kürzel abgespeichert.(Damit werden die Einstellung codiert, die du getroffen hast. Filter etc.)
Ohne diese beiden Informationen kann dir Heribert nur schwer helfen.
Siehe auch hier:
Hier werden die Parameter und die dazugehörigen Einstellungen beschrieben.
https://www.mikroskopie-forum.de/index.php?msg=391727

Ich versuche jetzt, dass die Tiefenkarte so homogen und fließend aussieht wie nur möglich.
Sonst macht sich das im 3D-Bild bemerkbar.


Ich bin ja eher ein Freund von wenigen Bildern. Manchmal ist eine größere Tiefenschärfe unschlagbar. Time is money. Du kannst die Bilder auch verkleinern(linkes Bild: Dialog Enhance und dort "Resize Image", dann "Apply to all images"), dann geht alles schneller. Und es geht ja oft ums Zeigen und nicht um ein Coverbild. Keine Überstrahlungen in deinem Bild, das ist schon mal gut.

Liebe Grüße
Rudolf

[rlu]

Hallo Heribert,

Eine grundsätzliche Frage
1. Falls es sich um ein nicht durchscheinendes Objekt handelt, schwarzer Käfer. Dann doch immer "Prefer High"
~ Pyramide, die ersten Bilder, die von oben einen Kontrast haben werden genommen.

2. In diesem Fall, Stechmücke, die ist semitransparent. Es kommt  doch darauf an was man will:
a. nur die Oberfläche, kein 3D-Bild, dann auch wieder "Prefer High" entspricht der ~Pyramide
b. 3D Bild, semitransparent, mit einer Übersicht der inneren Strukturen, die aber nur im 3D Bild sichtbar werden.

Nutzt man 2b ohne 3D, dann wird das Bild flau. Weil obere und untere Schichten im Bild gemischt werden.
Ist das so?

Liebe Grüße
Rudolf

[SamuelReicher]

Super 

Danke für die Antworten 

Nach der Arbeit gehts weiter, nebenbei läuft der 3D drucker für den Lamdafilterschieber  bin gespannt was ich noch rausholen kann.

Die Software finde ich übrigens spitze.

[Heribert Cypionka]

Zu Rudolfs Fragen:

Eine grundsätzliche Frage ... Es kommt  doch darauf an was man will:

Also:

- Normalerweise selektiert der PICOLAY-Stacking Algorithmus die schärfsten Pixel im Stapel.

- Mit 'Prefer High/Low frames' kann man die Bewertung (Score) in den Schichten des Stapels verschieben. Bei 100% Präferenz bekommt die oberste Schicht 50% mehr (bzw. weniger) Score als die Mitte des Stapels, und die unterste entsprechend 50% weniger (bzw. mehr). In der Mitte bleibt es gleich. Dadurch kann man Strukturen hervorheben oder abschwächen, wobei es durch die Methode auch zu Verschiebungen in der Tiefenkarte kommt. 

- Bei der neuen Funktion 'Pixel > Minimum Score [%]' werden auch Pixel selektiert, die nicht den höchsten Score im Stapel aufweisen, aber mehr als den gesetzten Mindestwert (unter Minimum Score). Diese Pixel werden mit den Maximum-Pixeln gemischt, bzw. überschreiben diese komplett im Fall von 100%. Die Mischung gilt auch für die Tiefenkarte.

- Um die Sache wirklich kompliziert zu machen: Man kann die Präferenz und die Auswahl von Pixel > Minimum Score auch zusammen anwenden...

Zugegeben, ganz einfach ist das nicht, aber sehr flexibel!

LG
Heribert

[SamuelReicher]

Ok Frage 

Vielleicht weiß jemand warum Picolay bei 40 bis 50 Bildern das Stacking beendet? 

 

[SamuelReicher]

So jetzt brauche ich neue Proben 

[rlu]

Hallo Samuel,

sieht doch viel besser aus.(Der Beitrag davor Einzelbild)
Was hast du alles verändert?
Zeig doch mal die Tiefenkarte dazu(grünes Bild).

Kann ich dir nicht beantworten, ich höre bei 10 Bildern auf.
Ich weiß man sollte mehr nehmen, aber ich mache ja keine Käfer.
Wie groß sind deine Bilder?
Mit wie vielen Bilder hast du gearbeitet?

Die Frage wäre noch offen:
Nutzt man semitransparente Bilder ohne 3D, dann wirkt das Bild flau. Weil obere und untere Schichten im Bild gemischt werden. Nur ein 3D-Blick hebt diesen Nachteil auf, das Bild wird scharf und man erkennt die Lage der Einzelteile im Raum.
Ist das so?

Liebe Grüße
Rudolf

[SamuelReicher]

Also, die Tiefenkarte habe ich am Computer, ich schau ob ich sie finde.

Ich hab das mit dem video gelassen und verwende 10 bis 20 Bilder die ich seperat aufnehme.
Ich mach normalerweise auch keine Larven, hab aber gerade nichts anderes in Reichweite.

Das mit 3D - ich weiß es ehrlich gesagt nicht. Ich schau aber nachher. Wie ich mich kenne, mache ich in einer Stunde die nächsten versuche 

Ich hab schon abdrücke von den Okularen um die Augen    

Jetzt mal Pause

[Peter V.]

Hallo Samuel,

könnte Du allen einen Gefallen tun und nicht bei jeder Antwort den kompletten langen Text des Vorschreibers zitieren? Danke.

Herzliche Grüße
Peter

[SamuelReicher]

Mist, mein altes Thema wieder. Ja mach ich, ich hoffe ich schaff es irgendwann mir das abzugewöhnen